Biologi computazionali - bioinformatici per laboratorio deep sequencing c/o ITB/CNR, Milano

Il laboratorio di Sequenziamento Massivo dell’Istituto di Tecnologie Biomediche - Consiglio Nazionale delle Ricerche di Milano conduce da diversi anni una serie di progetti sulle seguenti tematiche:
Sequenziamento ed annotazione di genomi e trascrittomi batterici;
identificazione ed annotazione di nuovi miRNA umani;
caratterizzazione di trascrittomi tumorali;
identificazione di mutazioni a livello genomico nucleare e mitocondriale;
sequenziamento ed annotazione di regioni ipervariabili di virus;
sequenziamento ed annotazione funzionale di trascrittomi vegetali;
sequenziamento di ancient DNA.
La tecnologia utilizzata è la Roche FLX 454. Le competenze attuali del gruppo spaziano dalla biologia molecolare all’informatica, scienza dell’informazione, chimica, fisica e statistica.
Per integrare e supportare il team esistente di analisi dati ricerchiamo i seguenti profili:
Un(a) biologo(a) computazionale: preparazione in biologia molecolare e/o genetica e/o biologia strutturale, buona familiarità con algoritmi e tecniche di analisi di sequenza e forte interesse nell’analisi e annotazione di sequenze di genomi e trascrittomi batterici e di eucarioti. La conoscenza di un linguaggio di scripting (Perl o Python in ambiente UNIX) costituirà titolo preferenziale.
Un(a) informatico(a): Perl, Python o Java in ambiente UNIX; MySQL e/o Postgres; buona conoscenza ed interesse per Information Technology e system management Windows / UNIX / MacOsX. Preferibilmente con preparazione specifica in bioinformatica legata ad analisi di sequenza, mutation detection, SNP analysis, genomica comparativa e/o trascrittomica. Esperienza o forte  interesse nella creazione di pipeline computazionali di supporto all’analisi ed annotazione di dati di sequenza ad alto parallelismo e nell’implementazione e mantenimento di siti web legati ai singoli progetti sono le caratteristiche ideali di questo profilo.
Per ambedue le posizioni la preparazione di partenza ideale è a livello di laurea specialistica o primo post-doc.  Sarà fornito training  (on the job e con corsi mirati) per adattare le conoscenze pregresse al lavoro di analisi per tutti e due i profili. La conoscenza dei principi dell’analisi statistica dei dati e di un linguaggio o software per l’analisi quantitativa dei dati costituiranno un fattore preferenziale, ma non necessario, per la selezione. Inquadramento contrattuale come collaboratori o ricercatori CNR a tempo determinato (per i profili con tre anni di esperienza post-laurea), con retribuzione commisurata all’esperienza e in ogni caso di sicuro interesse per i candidati qualificati. L’attività di formazione viene supportata anche incoraggiando e finanziando la partecipazione a meeting e workshop internazionali.
Per ulteriori informazioni  e/o per applicazione (CV ed il nome di un referente), spedire una mail al dott. Gianluca de Bellis: gianluca [dot] debellis [at] itb [dot] cnr [dot] it. Le posizioni sono disponibili immediatamente.