Responsabile: Emerson Andy

Descrizione: Questo corso è stato concepito con l'idea di fornire ai bioinformatici o ai bio-ricercatori con alcuna esperienza di programmazione un supporto di conoscenza sufficientemente solido da cominciare a sviluppare le proprie applicazioni in Perl. Questo è il linguaggio di elezione per molte applicazioni bioinformatiche in quanto è adatto per gestire stringhe di testo, come ad esempio sequenze genomiche e proteiche. In aggiunta, i database di tipo biologico contengono molto spesso informazioni sotto forma di annotazioni e stringhe di testo, efficacemente estraibili e gestibili da Perl. All'inizio del corso verranno trattati in breve i comandi base di UNIX necessari per utilizzare efficacemente il Perl

Argomenti:
Variabili scalari e array
Funzioni e cicli.
Subroutine e reference
I Regular expression e pattern matching
Gestione di file
L'uso di Perl in Unix
Introduzione a oggetti Perl.

Destinatari: Biologi, Bioinformatici e tutti coloro che, pur non avendo esperienza di programmazione, desiderino usare Perl per scrivere semplici applicazioni e programmi.
Prerequisiti: Nessuno
Metodo: Lezioni teoriche seguite da esercitazioni pratiche in laboratorio
Documentazione: Copia del materiale presentato
Durata: 3 giorni
Agevolati: utenti CINECA, studenti universitari e ricercatori anche di universita' non consorziate
Massimo numero di studenti: 24
Minimo numero di studenti: 6