Negli ultimi anni, l'emergere dei concetti di ricerca traslazionale e di medicina personalizzata, correlati all’avvento di nuove tecniche di sequenziamento del genoma, ha messo a disposizione dei ricercatori enormi quantità di dati molecolari e clinici, che contengono informazioni cruciali per l’evoluzione delle discipline mediche e bioinformatiche. Perchè queste nuove sfide scientifiche si concretizzino in effettivi benefici per ogni paziente, occorre che siano sviluppati dei validi metodi di ottimizzazione della gestione dei dati biomedici, in modo da renderli il pilastro di pratiche cliniche proattive, preventive e partecipative.

In questo contesto, tra le più importanti opportunità per la bioinformatica clinica vi sono la crescente necessità di strumenti per la condivisone dei dati e la disponibilità di campioni biologici provenienti da coorti di pazienti ben caratterizzate. La prospettiva di colmare il divario tra le scoperte in ambito molecolare e la pratica clinica, richiede sia notevoli progressi computazionali, sia la realizzazione di solide infrastrutture che consentano di sintetizzare le nuove conoscenze in risultati fruibili.

Per questi motivi, le biobanche, ovvero raccolte organizzate di campioni biologici e dei dati ad essi associati, hanno acquisito sempre maggiore importanza in ambito clinico e nella medicina personalizzata. Se le biobanche sono sempre più riconosciute come un'infrastruttura fondamentale per la ricerca, nel contempo l’eterogeneità delle pratiche tecniche e normative di biobanking può rappresentare un ostacolo alla ricerca traslazionale e alla fattiva collaborazione tra i centri, limitando l'accesso ai campioni e ai dati.

Il workshop “IT solutions for integrating clinical and molecular data to support biomedical research: from biobanks to knowledge repositories” si propone di presentare e confrontare le esperienze di alcuni centri di eccellenza, italiani ed internazionali, per analizzare le attuali opportunità di armonizzazione e condivisione delle metodologie legate alla gestione informatizzata dei dati raccolti delle biobanche.

La finalità del gruppo di lavoro sarà quella di determinare i principi generali per la condivisione delle strutture informative, dei protocolli di scambio delle informazioni e delle procedure per il riutilizzo dei dati clinici tra le biobanche italiane. Grazie alla collaborazione tra più domini di ricerca, la discussione includerà anche temi di rilevanza clinica - quali la diagnostica molecolare di alto profilo coordinata con informazione legate ai campioni contenuti in biobanca - e normativa - ad esempio i vincoli giuridici per il riconoscimento delle strutture e l’accreditamento delle diagnosi attraverso le biobanche.

Sulla base delle indicazioni definite durante il workshop, si potranno configurare le future collaborazioni tra i diversi centri ospedalieri e di ricerca, creando un framework basato sulla standardizzazione delle procedure e delle infrastrutture organizzative per la gestione e la convalida dei flussi informativi e permettendo di trasformare le biobanche in raccolte di conoscenza strutturata.

COMITATO SCIENTIFICO

Prof.Riccardo Bellazzi, Dipartimento di Ingegneria Industriale e dell’Informazione, Università Studi di Pavia

Prof.Mario Cannataro, Ingegneria Informatica e Biomedica, Università Magna Graecia, Catanzaro

Dott.Flavio Licciulli / Dott. Sabino Liuni, Istituto di Tecnologie Biomediche, CNR, Bari

Dott.Luigi Varesio, Laboratorio di Biologia Molecolare, Istituto G.Gaslini, Genova

Dott.Alberto Zambelli, Fondazione Salvatore Maugeri, Pavia

PROGRAMMA

La giornata si svolgerà, il 23 Novembre 2012, presso l’Aula Goldoniana del Collegio Ghislieri, a partire dalle ore 9.30.

Gli interventi si svolgeranno in lingua inglese.

Registration and Introduction

Riccardo Bellazzi, Università Studi di Pavia - Welcome and Introduction

Jan Talmon, Maastricht University - The PSI biobank infrastructure of the Academic Medical Centers in the Netherlands: now and in the future

Maria Grazia Daidone, Istituto Nazionale Tumori, Milano - Biobanks, clinical and molecular data collection to support research: management, regulatory issues and access procedures

Session 1 - Clinic and omic data integration, italian experiences

Luigi Varesio, Istituto G.Gaslini, Genova - Biobank Integrating Tissue-and-Omic (BIT): the base for virtual biobanking and functional medicine

Daniele Segagni and Alberto Zambelli, Fondazione Salvatore Maugeri, Pavia - Clinical Bioinformatics - the i2b2 Pavia projects

Session 2 - Clinic and omic data integration, italian experiences

Flavio Licciulli, Istituto di Tecnologie Biomediche, CNR, Bari - The integration of oncological Biobanks and biomedical databases: the experience near Puglia’s centres

Mario Cannataro, Università Magna Graecia, Catanzaro - Microarray data analysis for translational research and pharmacogenomics: experiences at University of Catanzaro

Panel discussion - Technological infrastructures for research data sharing

Riccardo Bellazzi, Università Studi di Pavia

Marco Fato, Laboratorio di Bioingegneria e Bioimmagini, DIST, Genova

Luciano Milanesi, Istituto di Tecnologie Biomediche CNR, Milano

Paolo Romano, San Martino IST, Genova

INFORMAZIONI e CONTATTI

La partecipazione al workshop sarà gratuita. Occorrerà registrarsi all’evento inviando i propri dati all’indirizzo mail aridag@gmail.com o telefonicamente al numero 0382-592044.