The Laboratory of Ecology and Evolution of Plankton at the Stazione Zoologica in Naples is sequencing the genome of Pseudo-nitzschia multistriata, a small diatom that is being used as model organism to understand diatom biology. A position is available to analyse the sequencing data obtained through the Illumina/Solexa technology and to annotate and finish the genome, integrating RNA-seq data. For this project we are collaborating with The Genome Analysis Centre based in Norwich, UK. The candidate will spend a few weeks in Norwich to learn the bioinformatics required for assembling the genome and will continue his/her work at the Stazione Zoologica, contributing to the development of functional genomics approaches for species of the Pseudo-nitzschia genus. Knowledge in basic programming in a Unix/Linux environment is required. Basic experience in molecular biology and cell cultures is desirable but not mandatory.
The application form (in Italian) can be found here http://bit.ly/xVdWE6
The position code is n° 03/2012
Application deadline February 24, 2012
For further information please contact mariella.ferrante@szn.it
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Il Laboratorio di Ecologia ed Evoluzione del Plancton alla Stazione Zoologica di Napoli sta sequenziando il genoma di Pseudo-nitzschia multistriata, una piccola diatomea che viene utilizzata come organismo modello per studiare la biologia delle diatomee. E’ disponibile un posto per analizzare i dati di sequenziamento ottenuti tramite la tecnologia Illumina/Solexa e per annotare e completare il genoma, integrando dati di RNA-seq. Per questo progetto stiamo collaborando con The Genome Analysis Centre che ha sede a Norwich nel Regno Unito. Il candidato dovrà trascorrere alcune settimane a Norwich per acqusire gli strumenti necessari per l’assemblaggio e l’annotazione del genoma e continuerà il suo lavoro presso la Stazione Zoologica, contribuendo allo sviluppo di approcci di genomica funzionale per le specie del genere Pseudo-nitzschia. E’ richiesta conoscenza di programmazione di base in un ambiente Unix/Linux. Esperienza di base in biologia molecolare e colture cellulari rappresentano una competenza desiderabile sebbene non indispensabile alla candidatura.
Il modulo di partecipazione si trova sul sito SZN all’indirizzo http://bit.ly/xVdWE6
Il codice del bando è n° 03/2012.
La scadenza per la presentazione delle domande è il 24 febbraio 2012.
Per maggiori informazioni contattare mariella.ferrante@szn.it
