Verranno presentati i principali campi di applicazione offerti dalla tecnologia NGS, le relative metodologie e gli algoritmi per l’analisi bioinformatica e gli strumenti attualmente disponibili, con particolare riferimento all'identificazione di varianti (exome sequencing), lo studio dell'espressione genica (RNA-Seq) e l'analisi metagenomica.
Oltre la metà del corso consiste in esercitazioni pratiche guidate.
I corsi sono rivolti a medici, biologi, tecnici e ricercatori delle Scienze della Vita che lavorano o sono interessati a lavorare con dati di sequenziamento di prossima generazione.
Il corso verterà sull'uso di Galaxy, un framework computazionale aperto basato sul web, che permette ai ricercatori senza particolari expertise di programmazione di condurre sofisticate analisi sui dati.
Nessuna installazione di software è richiesta da parte dei corsisti.
Il corso rientra in una serie di attività di formazione organizzate dal CRS4 sull'analisi dati di Next Generation Sequencing (NGS).